Atributele PDB

58

Tabelul urmator conţine atributele şi definitia lor.

Atribut

Definiţie

author

Un autor asociat cu o structură, fie ca submitter, fie ca primă sau a doua citare.

compound

Text gasit īntr-o īnregistrare PDB COMPND ce descrie componentele macromoleculare ale unei intrări PDB.

title

Text găsit īn īnregistrarea PDB TITLE care descrie experimentul sau analiza macromoleculei.

class

Text găsit īn īnregistrarea PDB HEADER care clasifica macromolecula.

het

Text găsit īn īnregistrările HET, o abreviere de 3 caractere alfanumerice pentru grupurile HET.

hetdesc

Descrierea grupului HET aşa cum este găsit īn īnregistrarea HET.

idcod

Text ce descrie unicul identificator PDB aşa cum este găsit īn īnregistrarea PDB HEADER si care consta din 4 caractere alfanumerice.

jrnl

Text găsit īn īnregistrările PDB JRNL care contine citatia ce descrie cel mai bine modelui folosit la introducerea acestor date.

keywords

Text găsit īn īnregistrarea PDB KEYWDS.

reference

Text găsit īn īnregistrarea PDB REMARK 1 care descrie toate citarile asociate cu modelul gasit.

remarkn

Text găsit īn orice īnregistrare PDB REMARK

source

Text găsit īn īnregistrarea PDB SOURCE care descrie sursa biologica şi/sau chimică a fiecărei molecule din această intrare.

technique

Text găsit īn īnregistrarea PDB EXPDTA care descrie metoda utilizată pentru a analiza structura. Valorile raportate pot fi: "ELECTRON DIFFRACTION", "ELECTRON MICROSCOPY", "FIBER DIFFRACTION", "FLUORESCENCE TRANSFER", "NEUTRON DIFFRACTION", NMR, "THEORETICAL MODEL", şi "X-RAY DIFFRACTION"

Redundanţa īn PDB

    Ca depozit unic mondial pentru structurile macromoleculare, Protein Data Bank menţine un corp de date care prezintă o redundanţă considerabilă atāt īn ceea ce priveşte atāt secvenţa cāt şi structura.

© Cornel Mironel Niculae, 2003-

12-Jan-2012